一、采購項目名稱及內容 采購人：廣西壯族自治區疾病預防控制中心； 采購項目名稱：免疫規劃檢測項目測序服務； 項目編號：--（重）； 資金來源：財政資金。 二、項目內容 （一）菌株全基因組測序：次。 ．樣本類型：純化后的滅活細菌。 ．提取：采用或的方法對樣本的基因組 進行提取，之后利用瓊脂糖凝膠電泳檢測 的純度和完整性，利用進行定量。 ．文庫構建： 經電泳檢測合格的 樣品用 超聲波破碎儀隨機打斷成長度約為的片段。處理完成后的片段，使用 ?? (, )試劑盒，經末端修復、加尾、加測序接頭、純化、擴增等步驟完成整個文庫制備。 ．文庫檢測：文庫構建完成后，先使用 . 進行初步定量，稀釋文庫至 /，使用 對文庫的插入片段進行檢測， 符合預期后，使用 - 方法對文庫的有效濃度進行準確定量，以保證文庫質量。 ．測序和交付平臺：使用 上機測序，運行智能化交付系統和自動化樣本庫系統； ．數據質量：原始下機數據測序質量要求: ≥%，≥%； ．數據量： ≥/樣本； ．數據交付：需要交付 ； ．周期要求：需要保證項目可加急得到響應，二代測序儀充足≥臺； ．生物信息學分析內容： ①　原始下機數據處理:過濾測序質量值低的，保留高質量，得到 ； ②　樣品組裝: 進行基因組組裝，得到能反映樣品基因組基本情況的序列文件，并對組裝結果進行評價； ③　基因組組分分析 組裝完成后，分析樣品基因組的成分，包括編碼基因、非編碼、重復序列、前噬菌體、基因島、等基因組成分的預測； ④　功能注釋 針對編碼基因序列進行不同數據庫的功能注釋，包括常用的、數據庫、針對病原微生物的數據庫； ⑤　基因組比較分析 此步驟從基因組、基因兩層面分別比較樣品與參考基因組的差異，包括共線性分析、基因家族構建、共有/特有基因分析、物種進化樹構建。 （二）一代測定服務：....